О храмеС 1936 по 1990 гг. в г. Валки не было ни одного храма. До 1933 г. храмов было шесть. Все они были разрушены во времена советской власти. В 1990 г. с благословления Владыки Никодима в Валках был открыт приход. Под церковь было оборудовано помещение, которое когда-то было сторожкой Свято-Преображенского храма, а со временем было домом для трёх семей.
Первым настоятелем храма был священник Евгений Николаевич Найдина, а уже в марте 1991 г. в храм приехал новый священник – Ковальчук Валентин Николаевич, ныне инспектор Харьковской духовной семинарии. В 1992 г. заботами отца Валентина начато строительство нового Свято-Преображенского храма, а уже 29 августа 1993 г. Владыкой Никодимом был освящён новый храм. В 1998 г. назначен новый настоятель о. Сергий Ведерников. Заботами о. Сергия на территории храма возведена часовня в честь Святителя Николая, в которой находится колодец.
С декабря 2000 г., настоятелем храма служит о. Иоанн Пилипов. 29 сентября 2002 г., с благословления Владыки Никодима, создан новый, 19-й благочинный округ. Благочинным округа назначается настоятель Свято-Преображенского храма.
29 августа 2003 г. храм праздновал своё десятилетие.
